آگاه: نامبرده مدتی به‌عنوان مسئولِ امنیتی- نظامیِ ستاد منافقین در مشهد فعالیت کرده و در اواخر سال۱۳۵۹، به شمال گریخته و در قائمشهر و بابل، مشغول فعالیت می‌شود. شایان ذکر است وی در سال۱۳۶۰ از کشور خارج شده و به کردستان عراق می‌رود.
دیگر فعالیت‌ها و مسئولیت‌های وی عبارت است از:
ـ مسئول شکنجه افراد معترض و مسئله‌دار از دیدگاه گروه
ـ معاون ابراهیم ذاکری، مسئول و هادی عملیات‌های نظامی ـ تروریستی، ارتباطات و اعزام تیم‌های ترور به داخل کشور طی هماهنگی با استخبارات عراق
ـ مسئول نظامی استان‌های خراسان، کرمان و سیستان و بلوچستان، پس از تقسیم‌بندی استان‌ها در گروه
ـ معاون هیئت اجرایی منافقین در سال ۱۳۶۴
ـ مسئول تیم در عملیات‌های نظامی- تروریستیِ آفتاب، چلچراغ، فروغ جاویدان و مروارید
ـ مسئول مقر حبیبِ منافقین برای اعزام نفرات به داخل کشور و مسئول اطلاعات در گروه تروریستی منافقین
ضمنا مرتضایی تحت تعقیب اینترپل بوده و دارای اعلان قرمز به شماره A-۱۲۸/۱-۲۰۰۹ است.
۲۸ مهر ۱۴۰۳ - ۱۲:۲۶
اسماعیل مرتضایی، متهم ردیف ۹۹ در دادگاه رسیدگی به جرایم گروهک تروریستی منافقین (مجاهدین خلق) است.وی قبل از انقلاب در جریان گروه والعصر قرار گرفته و سپس جذب گروهک تروریستی منافقین خلق می‌شود.