آگاه: متعاقبا نامبرده با یکی از اعضای این تشکیلات به نام جلال شریفی ازدواج کرده و در زمان حمله‌ رژیم بعث به ایران به اتفاق همسرش عازم عراق می‌شود.

وی در گروهک تروریستی منافقین مسئولیت‌های متعددی ازجمله مسئول اول مقر اشرف محافظ مریم رجوی جانشین مریم و... داشته است.

همچنین مشارالیها در عملیات‌ نظامی تروریستی فروغ جاویدان و نسل‌کشی اکراد عراق موسوم به مروارید نیز شرکت می‌کند.

در ضمن وی در سال‌۱۳۷۲ به همراه مریم رجوی از کشور عراق خارج شده و در کشورهای اروپایی، اقدام به جمع‌آوری کمک‌های مالی برای اهداف تروریستی تشکیلات می‌کند.

نامبرده در ادامه مجددا در سال۱۳۷۵ به عراق بازگشته و مسئول یکی از مقرهای شاخه‌ نظامی گروهک تروریستی منافقین می‌شود.

این مقر چندین عملیات مرزی در منطقه‌ قصرشیرین نفت شهر و حمله به مرزبانان جمهوری اسلامی را سازماندهی کرده است.

همچنین طی سال‌های ۱۳۷۶ تا ۱۳۸۰ که تیم‌های عملیاتی تشکیلات پس از آموزش‌های لازم به‌منظور ارتکاب اقدامات تروریستی به داخل کشور اعزام می‌شدند، پارسایی در نشست‌های جمعی اعضای تیم را توجیه تشویق و ترغیب به انجام این اقدامات می‌کند. به همین دلیل نیز اقدامات و فعالیت‌های مشارالیها موجب می‌شود مسعود رجوی در نشست جمعی اعلام کند بیشترین راندمان عملیاتی ازسوی قرارگاه تحت فرماندهی مژگان صورت گرفته و مژگان سازمان را نجات داده است.

گفتنی است؛ وی مدتی نیز مسئولیت تشکیلات گروهک در فرانسه را برعهده گرفته و پس از آن به مقر اشرف۳ در آلبانی منتقل و در قسمت مالی تامین مالی تروریسم تشکیلات مشغول‌به‌کار می‌شود.

مژگان پارسایی یکی از عوامل اصلی تشکیل طراحی سازماندهی و هدایت تیم ترور امیر سپهبد علی صیاد شیرازی و نتیجتاً شهادت و به تعبیر حقوقی قتل‌عمد این شهید والامقام محسوب می‌شود.

ضمنا نامبرده تحت تعقیب اینترپل بوده و دارای اعلان قرمز به شماره ۲۰۰۲-۴۲۶/۶-A است.